Изчисляване на изчислителната квантова механика: 4 стъпки

2024 Автор: John Day | [email protected]. Последно модифициран: 2024-01-30 07:51

Изчислителните изчисления в химията и физиката могат да разкрият много интересни свойства на някои образци (особено ако те подлежат на промяна за по -добра ефективност на дадено оригинално съединение). в процедурите, освен фактори на диполния момент, нестабилността, картата на електростатичния потенциал, енергийната диаграма и изчисленията на пропабилистичната реактивност, където използването на изчислителни квантови изчисления съкращава лабораторното време, което прави ясно и конкретно дали синтезът на възможно съединение е жизнеспособен. икономически и времево казано.

Консумативи

• Квантова
• Моделиране на молекули.
• Молекулни орбитали Orca Avogadro

Стъпка 1: Изчисляване на квантовата механика - Avogadro

Като първа стъпка изтеглете Avogadro, който има възможност за въвеждане със софтуер Orca

В софтуера Avogadro гарантирано ще създадете вашите молекули и ще ги оптимизирате с 99,9%; за да се избегнат конфликти с командата Ctrl + Alt + o, което от своя страна не гарантира правилна молекулна компресия при използване на входни разширения за Orca.

За да оптимизирате молекулата, първо създайте интересуващата ви молекула (очевидно), след това щракнете върху E (имайте предвид, че под тази E има стрелка надолу), така че подобно изчисление ще се появи в горния ляв ъгъл на екрана, съдържащ софтуера.

Стъпка 2: Софтуерната Orca

Когато този вход е направен правилно, щракнете върху раздела за разширения, все още се отнася до софтуера Avogadro, и потърсете опцията ORCA

Щракнете върху Разширено, когато се отвори екранът за създаване на въвеждане, и върху Дата маркирайте опцията MO и втората по -долу. - ОСТАВЕТЕ ДВЕ МАРКИ - за да получите електронна плътност и активирани молекулни орбитали по време на квантовите изчисления, които Orca ще извърши - само процедури за въвеждане;)

След такава процедура в раздела Основни, завършете след командата:! RHF SP def2-SVP

въведете кода правилно / внимателно …

! Нормален отпечатък

% изход

Отпечатайте [P_Basis] 2

Отпечатайте [P_MOs] 1

край

ПОДРОБНО, преди да извършите такава операция, изтеглете и инсталирайте Orca на вашия компютър!

След като изпълните горните команди, щракнете върху Създаване и запазете такъв файл. Влезте в папката, където е инсталиран Orca. (Пример: инсталирах Orca на C устройството на моя компютър -> запишете файла в C устройството на вашия компютър в папката Orca).

Стъпка 3: В Cmd Run…

Отворете cmd и въведете:

cd C: / Orca; Софтуерът Orca е инсталиран на C устройството на вашия компютър … и натиснете enter.

Ще получите екран, подобен на картината на тази част, след такава процедура забележете дали командата е правилна от скрипта C: / Orca> Ако тази команда е правилна, въведете пред знака плюс (>) командата:

orca.exe (името на молекулата, която сте записали в папката Orca).inp> (името на молекулата, която сте запазили в папката Orca).out

ПОДРОБНОСТ - В КОМАНДАТА НЯМАТ РОДНИ И САМО ИМЕТО НА ВАШАТА МОЛЕКУЛА

След това натиснете enter и изчакайте … В моя случай пропуснах командата няколко пъти, защото множеството е нечетна стойност и броят ми електрони също е нечетен, ако това се случи, променете стойността на множествеността на 2 в предишната стъпка в Basic (в Софтуер Avogadro).

Стъпка 4: Изчакайте минутка …

След като командата бъде дадена, потърсете подчертаване в следващия команден ред на cmd

ако има, WONDER, продължава… Изчакайте малко, докато се появи терминът на скрипта:

cd: / Orca_

За да сте сигурни, че вашият.out файл е генериран в инсталационната папка на Orca, тази, в която е записан входният файл, създаден в Avogadro.

След като изчислението е извършено чрез cmd в Orca, потърсете файла.out в папката Orca. В този момент можете да затворите молекулата си (Avogadro) и cmd, в крайна сметка квантовото изчисление вече е направено …

В следващата стъпка отворете отново Avogadro и в отворения раздел потърсете генерирания.out файл и го отворете; ще видите, че ще има вашата молекула до стойностите на HOMO и LUMO Orbital, плъзнете раздела малко надолу и ще видите, че има изчисления за орбитали, които ще дадат около 100% оптимизация, както показва изображението.

…и се забавлявай…